魏冬青

上海交通大学生命学院生物信息与生物统计系以及微生物代谢国家重点实验室长聘教授

个人介绍：

上海交通大学生命学院生物信息与生物统计系以及微生物代谢国家重点实验室长聘教授。Nature-Springer SCI期刊"Interdisciplinary Sciences – Computational Life Sciences"主编， “J. Mol. Graph and Modeling”, "Molecular Simulation"等10家杂志编委。发表SCI文章200多篇， 主编专著9部，SCI引用 超过 5000次， H因子47。获得横山亮次(Yokoyama Ryōji)奖，上海交大科学技术奖和上海市优博导师称号。卫生信息学会大数据应用评估与保障专业委员会副主委、国际交叉科学学会会长。

议题：

超级计算与精准新药发现

议题介绍：

基因突变包括单核苷酸多态性(SNP)、核苷酸序列重复、插入以及缺失等，其可能会引起编码蛋白的氨基酸序列改变，导致蛋白结构变化而影响活性，也有一些位于调控区的基因突变可能引起功能蛋白表达量的差异。现已发现多种编码药物代谢酶、转运蛋白以及作用靶点蛋白(如受体)的基因存在着基因多态性，其中药物代谢酶基因多态性可能影响到药物吸收、分布、代谢和排泄的药动学过程，导致患者出现严重毒性反应或治疗无效。 我们开发了分子模拟与计算机辅助药物设计软件SAMM，构建细胞色素P450酶多态性基因型-表型相关性数据库。把支持向量机，神经网络，贝叶斯等非线性方法开发了统计预测模型以及基于web的软件工具并应用到药物构效关系，药物代谢以及毒理和基因表型相关性的研究中。 开发了SNPs及ADMET 在线预测平台, 并将其应用到各种典型体系，对个性化药物用药有一定的指导意义。